1、立案庭（诉讼服务中心）：负责立案、涉诉信访、诉调对接、多元调解、司法确认、速裁、司法辅助事务等工作。

2、刑事审判庭：负责各类一审刑事案件和刑事自诉案件的审理。

3、民事审判庭（整合民事审判第一庭、民事审判第二庭）：负责各类一审民商事精审案件的审理。

4、综合审判庭（整合行政审判庭、审判监督庭）：负责审查行政机关申请强制执行案件；负责各类一审民商事速裁案件的审理。

5、执行局：负责执行法律规定应由本院执行的生效法律文书；负责执行异议案件的裁决、诉讼保全工作。

6、审判管理办公室（研究室）[整合信息管理中心、研究室]：负责综合文稿、文秘机要、信息宣传调研、新闻发布、代表委员联络、信息化、智慧法院建设及综合治理工作；负责案件质量评查、案件质效管理、阳光司法、审委会事务以及其他有关审判管理工作。

7、政治部（机关党委）[整合政治处、机关党委、监察室]：负责干警队伍思想政治教育、教育培训、组织人事、工资福利、陪审员管理、老干部管理、机关党建、监察督察等。

8、综合办公室（司法警察大队）[整合办公室、财务室、司法警察大队]：负责院长办公会等重要会议及决定事项的督办；负责本院的财务采购基建、固定资产、档案管理、车队管理、物业管理等日常司法行政工作；办理本院对外接待工作及其他有关事项；负责本院司法警察工作，配合实施执行措施。

9、马巷人民法庭：负责审理马巷、内厝、新圩辖区一审民商事案件及民事精审案件。

10、大嶝人民法庭：负责审理大嶝辖区一般的民商事案件及民事精审案件。